Интерпретация немецкой легенды о Фаусте. Манга «Фрау Фауст» рассказывает об Иоганне, учёной, странствующей по городам в поисках нечто для неё важного. Однажды она знакомится с юношей по имени Марион, укрывая его от человека, у которого тот якобы украл книги. Из рассказа Мариона выясняется, что книги принадлежат ему, и что его семья переживает тяжёлые времена. Тогда Иоганна предлагает юноше в течение пары дней обучаться у неё в обмен на помощь в её поисках…